Trước lượt trận hạ màn giải VĐQG Nhật Bản 2023, Yokohama FC gần như chắc chắn xuống hạng vì đứng bét bảng, kém đội xếp trên là Kashiwa Reysol 3 điểm và thua xa hiệu số bàn thắng thua (cách nhau 10 bàn).

Để trụ hạng, Yokohama FC phải thắng đậm Kashima Antlers và chờ Kashiwa Reysol thua đậm Nagoya Grampus. Tuy nhiên, đội bóng của Nguyễn Công Phượng không thể thực hiện điều kiện tối thiểu, đó là đánh bại Kashima Antlers.

Cho dù Kashima Antlers tung ra đội hình với nhiều cầu thủ dự bị, họ vẫn mạnh vượt trội Yokohama FC. Ngay trong hiệp 1, đội chủ nhà đã vượt lên dẫn trước 2-0 nhờ công Yuma Suzuki và Yuta Matsumura. Bước sang hiệp 2, Yokohama FC gỡ lại 1 bàn nhờ công Mauricio Pinto nhưng đó là tất cả những gì họ làm được.

Thua 1-2, Yokohama FC chính thức xuống hạng mà chưa cần tính đến kết quả của Kashiwa Reysol, đội sau đó cầm hòa Nagoya Grampus 1-1. Đây là kết cục được dự báo trước của Yokohama FC.

Sau khi thăng hạng ở mùa trước, Yokohama FC đã chiêu mộ cầu thủ ồ ạt và không tính đến việc xây dựng đội hình đủ mạnh cho HLV Shuhei Yomoda. Bản thân Nguyễn Công Phượng được Yokohama FC ký hợp đồng 3 năm nhưng gần như không được sử dụng.

Cựu tiền đạo HAGL không được ra sân tại giải VĐQG Nhật Bản 2023. Anh thậm chí không được đăng ký vào danh sách dự bị của Yokohama FC. Lần duy nhất Công Phượng ra sân chính thức là ở J.League Cup 2023, nhưng anh cũng chỉ vào sân ở những phút cuối trận. Đây cũng là lý do khiến tiền đạo quê Nghệ An bị HLV Troussier loại khỏi ĐT Việt Nam.

Với việc Yokohama FC xuống hạng, tương lai của Nguyễn Công Phượng trở thành dấu hỏi lớn. Nhiều người mong muốn Công Phượng trở lại V-League thi đấu như Quang Hải, Văn Toàn để tìm lại vị trí ở ĐT Việt Nam.